Từ khi thành lập đến nay, ngoài công tác bảo tồn nguyên vẹn và khai thác các giá trị di sản. Vườn quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng đã hợp tác với nhiều cơ quan, tổ chức trong nước và quốc tế tiến hành điều tra, nghiên cứu về đa dạng sinh học nhằm phục vụ cho mục đích bảo tồn. Kết quả đã phát hiện được nhiều loài mới và độc đáo về đa dạng sinh học.

Về động vật: Trong chương trình hợp tác nghiên cứu với Vườn thú Cologne - Cộng hoà liên Bang Đức từ năm 2002 đến nay đã ghi nhận và công bố được 10 loài mới cho khoa học thuộc lớp bò sát gồm có 3 loài tắc kè, 2 loài thằn lằn và 5 loài rắn trong đó có một loài đặc hữu của khu vực Phong Nha  Kẻ Bàng là  Tắc kè Phong Nha có tên khoa học là Cyrtodactylus phongnhakebangensis và 1 loài đặc hữu khu vực Trường Sơn là loài Rắn lục Trường Sơn có tên khoa học là Trimeresurus truongsonensis.

Trong chương trình phối hợp nghiên cứu đa dạng sinh học cá nước ngọt tại Vườn quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng giữa Trung tâm đa dạng sinh học Bắc Trường sơn của Tiến sỹ Nguyễn Thái Tự năm 2003 đã phát hiện 10 loài cá mới cho khoa học đưa tổng số loài cá của Vườn quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng lên 162 loài, đứng hàng đầu về đa dạng loài cá nước ngọt của Việt Nam.

Về thực vật Chương trình hợp tác nghiên cứu về đa dạng các loài lan tại Vườn quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng của các nhà khoa học thuộc Viện thực vật Cômarôp - Viện Hàn lâm khoa học Liên Bang Nga, Viện Sinh thái tài nguyên sinh vật, Trường Đại học Khoa học tự nhiên - Đại học quốc gia Hà Nội  đã phát hiện một quần thể Bách xanh đá có tên khoa học là Calocedrus rupestris được đánh giá là rộng lớn và cổ sơ  nhất khu vực Đông Nam Á

Những phát hiện trên đây đã góp phần quan trọng vào việc tôn vinh những giá trị của Di sản thiên nhiên thế giới Vườn quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng, đặc biệt là các giá trị về đa dạng sinh học, một tiêu chí quan trọng đang được đệ trình lên UNESCO để công nhận Vườn quốc gia Phong Nha - Kẻ Bàng là Di sản thiên nhiên thế giới lần thứ hai./.

Khám phá Phong Nha Nha Kẻ Bàng là một những điểm du lịch Xanh hấp dẫn hiện nay tại Việt Nam. Quý khách có thể liên hệ, Du Lịch Xanh Quảng Bình - 052.3836333 - 0903295730 - Email: quangbinh@dulichxanh.com.vn